"Апокрифи і леґенди з українських рукописів" у дзеркалі критики / Упорядкування, переклад (з німецької, польської, російської, чеської), передмова та примітки Ярослави Мельник; Львівський національний університет ім. І. Франка, Інститут франкознавства. – Львів: Логос, 2001. – 119 с.
Ільницький М. Ключем метафори відімкнені вуста…: поезія Ігоря Калинця. – Париж; Львів; Цвікау: Зерна, 2001. – 190 с. – (Бібліотека альманаху українців Европи «Зерна» 28 (36)).
Шкраб'юк П. Крехів: дороги земні і небесні – Львів: Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України; Видавництво Отців Василіян "Місіонер", 2002. – 415 с.
Ільницький М. Драма без катарсису: сторінки літературного життя Львова другої половини XX століття. – Львів: Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України, 2003. – Книга 2. – 256 с.
Шкраб’юк П. Серед зір і людей: поезії – Львів: Інститут українознавства ім І. Крип’якевича НАН України; Видавництво Отців Василіян «Місіонер», 2003. – 304 с.
Листи Михайла Грушевського до Михайла Мочульського / упорядкування, передмова та коментарі Наталії Ощипок; Львівський національний університет імені Івана Франка, Інститут франкознавства. - Львів, 2004. - 158 с.
Микола Ільницький: Біобібліографічний покажчик / Укладач Л.Ільницька; Науковий редактор і автор передмови В.Будний. – Львів: Видавничий центр ЛНУ ім. Івана Франка, 2004. – 254 с. – (Українська біобібліографія. Нова серія; Ч. 16).
Мочульський М. Іван Франко. Студії та спогади / [післямова Н. Ощипок]; Львівський національний університет імені Івана Франка, Інститут франкознавства. – Львів, 2005. – 138 с. – (Франкознавчі студії; вип. 3).
Шкраб’юк П. Монаший Чин Отців Василіян у національному житті України / Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України. – Львів : Видавництво Отців Василіян "Місіонер", 2005. – 439 с. + 56 вкл
Ільницький Микола. У фокусі віддзеркалень: Статті; Портрети; Спогади / Львівський національний університет імені Івана Франка. – Львів, 2005. – 552 с.
Мельник Ярослава. І остатня часть дороги… Іван Франко: 1908-1916. – Дрогобич: Коло, 2006. – 439 с.
Мельник Ярослава. Іван Франко й Biblia Apocrypha / Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України; Український Католицький Університет. – Львів: Видавництво Українського Католицького Університету, 2006. – 512 с, іл.
Апокрифи і леґенди з українських рукописів / Зібрав, упорядкував і пояснив др. Іван Франко. – Т. І: Апокрифи старозавітні: Репринт видання 1896 року / Передмова Ярослави Мельник; Львівський національний університет ім. І. Франка, Інститут франкознавства. – Львів, 2006. – 512 с.
Поети «Молодої Музи» / Упорядник, автор передмови та наукового апарату Микола Ільницький. – Київ: Дніпро, 2006. – 672 с.
Войнаровський В. Чорнівка І. Поселення IV-IX ст. на Буковині – Чернівці: Зелена Буковина, 2007. – 166 с.
В 2007 р. було завершено роботою над підготовкою та виданням тритомника присвяченого 750-річчю Львова, який є найбільшою з дотепер виданих історій міста.
Литвин М.Р., Науменко К.Є. Збройні сили України першої половини XX ст. Генерали та адмірали / Інститут українознавства імені І.Крип'якевича НАН України. Львів; Харків: "Видавництво Сага", 2007. - 244 с.
Гаврило Шило. Наддністрянський реґіональний словник. – Львів: Інститут українознавства ім. І.Крип’якевича НАН України, 2008 (Серія “Діалектологічна скриня”). – 288 с.
Я. Ісаєвич. Українське книговидання: витоки, розвиток, проблеми. - Львів: Інститут українознавства імені І.Крип'якевича НАН України, 2002. - 520 с.
Федун Петро – «Полтава». Концепція Самостійної України. Том 1. Твори / Упоряд. і відп. ред. М. В. Романюк; НАН України. Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича; Галузевий державний архів Служби безпеки України. – Львів, 2008. – 720 с., 16 с. іл.
Мацкевий Леонід. Археологічні пам'ятки Львова. - Львів: Логос, 2008. - 224 с.
Василь Горинь: Бібліографічний покажчик / НАН України; Інститут українознавства ім. І.Крип'якевича; Уклад. Л. Кужель; Упоряд. і ред. М. Дубас; Відп. ред. Ф. Стеблій. - львів, 2008. - 100 с.: 19 с. іл.
Негрич Микола. Скарби гуцульського говору: Березови. - Інститут українознавства ім. І.Крип'якевича при НАН України, 2008 (Серія "Діалектологічна скриня"). - 224 с.
Будний В., Ільницький М. Порівняльне літературознавство: підручник / Василь Будний, Микола Ільницький. – К.: Видавничий дім «Києво-Могилянська академія», 2008. – 432 с.
Грицак М. Скарби гуцульського говору: Росішка (вівчарство в текстах). - Львів: - Інститут українознавства ім. І.Крип'якевича при НАН України, 2008 (Серія "Діалектологічна скриня"). - 320 с.
Шкраб’юк П. Сто кроків до Храму: невідоме про відоме / Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України; ГО «Інститут національної пам’яті». – Львів: НВФ «Українські технології», 2008. – 436 с.
Іван Франко. Благовіщення. Порівняльний дослід біблійної теми. З додатком благовіщенської драми Івана Дамаскина в віршованім перекладі на церковнослов’янську мову / Упорядкування, публікація, передмова і примітки Ярослави Мельник. – Львів: Видавництво Українського Католицького Університету, 2009. – 132 с.
Бібліографія історії українсько-польських відносин: суспільно-політичні та економічні процеси (за матеріалами картотеки Мирона Кордуби) / Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України; Канадський інститут українських студій. Упоряд. О. Піх, О. Руда; вступ. стаття О. Піха. – Львів, 2009. – 314 с.
Шкраб'юк П. Голоси нічні і денні: на хвилях радіо "Незалежність". – Львів: НВФ "Українські технології", 2009. – 224 с.
Клапчук В. Гуцульщина та гуцули: економіка і народні промисли (друга половина ХІХ – перша третина ХХ ст.) /Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України, Прикарпатський національний університет ім. В. Стефаника.– Львів; Івано-Франківськ: Фоліант, 2009.– 508 с.
Західно-українська народна республіка. 1918-1923. Уряди. Постаті / Інститут українознавства ім. І. Крип'якевича; гол. ред. Ярослав Ісаєвич; упоряд.: Микола Литвин, Іван Патер, Ігор Соляр. - Львів. 2009. - 350 с.
Наталя Хобзей, Оксана Сімович, Тетяна Ястремської, Ганна Дидик-Меуш. Лексикон львівський: поважно і на жарт. Львів: Інститут українознавства ім. І.Крип'якевича НАН України, 2009 (Серія "Діалектологічна скриня"). - 672 с.
Ільницький М. На перехрестях віку: у трьох книгах. - К.: Видавничий дім "Києво-Могилянська академія"
Поети Празької школи. Срібні сурми: Антологія / Упорядкування, передмова та літературні сильвети М. Ільницького. – Київ: Смолоскип, 2009. – 916 с.
5 вересня 2024 р. у Львові відбулася міжнародна наукова конференція «депортації на українсько-польському пограниччі середини хх століття як злочини тоталітарних режимів проти людяності», співорганізаторами якої стали Львівська обласна рада, Інститут українознавства ім. І. Крип’якевича НАН України, Львівський національний університет імені Івана Франка, Національний університет «Львівська політехніка», Волинський національний університет імені Лесі Українки, Тернопільський національний педагогічний університет імені В. Гнатюка, Львівський історичний музей, львівські організації суспільно-культурних товариств «Надсяння», «Лемківщина», «Холмщина», «Любачівщина», «Устріки».